📄 Category

systems biology

135 papers

Systeembiologie kijkt niet naar losse onderdelen van het leven, maar naar hoe al die delen samenwerken als één groot, dynamisch geheel. In plaats van alleen genen of eiwitten te bestuderen, proberen onderzoekers in dit veld de complexe netwerken te begrijpen die cellen en organismen in stand houden. Het is de kunst om het grote plaatje te zien, waar duizenden interacties samenwerken om leven mogelijk te maken.

Op Gist.Science volgen we nauwgezet elke nieuwe preprint op bioRxiv binnen deze discipline. Wij verwerken elk onderzoek direct na publicatie en bieden zowel een toegankelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat zowel leken als experts de inzichten kunnen benutten. Hieronder vindt u de meest recente bijdragen aan dit snel evoluerende veld, direct van bioRxiv en nu voor u uitgelicht.

📄 systems biology

Network topology dictates sequential drug efficacy through bistability-mediated state switching

Door systematisch meer dan 59.000 netwerktopologieën te analyseren, onthult deze studie dat de sequentiële werkzaamheid van geneesmiddelen wordt bepaald door specifieke bistabiliteit mogelijk makende motieven – namelijk een positieve terugkoppelsluis gekoppeld aan antagonistische kruisbeïnvloeding – die toestaan dat het eerste geneesmiddel het systeem herschikt naar een onderdrukte toestand die ontoegankelijk is voor gelijktijdige behandeling, mits een kritisch therapeutisch venster wordt gerespecteerd.

Osman, T. O., Rios, K. I., Hart, A., Shin, S.-y., Nguyen, L. K.2026-05-05
📄 systems biology

DrugPTM-Bench: A Large-Scale Dataset for Predictive Modeling of Drug-Induced Cell Type-Specific Protein Post-Translational Modifications

DrugPTM-Bench is een groot, curatie benchmarkdataset die drug-geïnduceerde, celtype-specifieke eiwitposttranslationele modificaties over meerdere dimensies standaardiseert om robuuste voorspellende modellering van werkingsmechanismen en signaaldynamiek van geneesmiddelen in onbalans biologische contexten mogelijk te maken.

Badkul, A., Mottaqi, M., Xie, L., Xie, L.2026-04-30
📄 systems biology

Bidirectional network hubs: NT-genes as optimal targets for partial cancer reversal

Dit artikel stelt een kwantitatief dynamisch model voor dat aantoont dat het richten op hoogfrequente "NT-genen"—die fungeren als bidirectionele hubs die normale en tumorale genregulatienetwerken verbinden—een optimale strategie biedt voor het bereiken van een partiële reversie van het kankerfenotype, terwijl tegelijkertijd ontsnappingsroutes worden geminimaliseerd en de functie van normaal weefsel wordt behouden.

Gil Perez, G. J., Perez Rodriguez, R., Gonzalez, A.2026-04-30
📄 systems biology

Orchard management alters citrus root and rhizosphere microbiomes with functional consequences for plant performance

Dit onderzoek toont aan dat orchardmanagementpraktijken, met name het gebruik van houtsnippers, de microbiomen van citruswortels en -rhizosfeer herstructureren, wat leidt tot functionele veranderingen die de plantprestaties negatief beïnvloeden.

Ginnan, N., Jones, R., Wu-Woods, J., Pervaiz, T., El-kereamy, A., Ashworth, V. E., Hamid, M. I., Dawson, E. K., Strauss (…)2026-04-17