📄 Category

systems biology

139 papers

Metabolic Trans-Omic Analysis Reveals Key Regulatory Disruption of Energy Metabolism in Alzheimer's Disease

Deze studie integreerde transcriptoom-, proteoom- en metaboloomdata uit de dorsolaterale prefrontale cortex van Alzheimer-patiënten om een multi-layered regulatienetwerk te reconstrueren, waarbij werd vastgesteld dat een gecoördineerde downregulatie van energievormende pathways zoals de TCA-cyclus en oxidatieve fosforylering, gedreven door verminderde enzymhoeveelheden en inhiberende allosterische effecten, bijdraagt aan de bio-energetische tekorten bij de ziekte.

Katayama, T., Sugimoto, H., Morita, K. + 2 more2026-03-06📄 systems biology

Integrative Multi-omics Analysis of the Human Skeletal Muscle Response to Endurance or Resistance Exercise: Findings from the Molecular Transducers of Physical Activity Consortium (MoTrPAC)

Deze studie van het MoTrPAC-consortium toont aan dat acute uithoudings- en weerstandstraining in het menselijke skeletspierweefsel unieke en gedeelde moleculaire handtekeningen oproepen, waarbij epigenetische en metabolische veranderingen voorafgaan aan transcriptomische en proteïnome-antwoorden die worden gereguleerd door factoren zoals MEF2A en NFIC.

Keshishian, H., Many, G. M., Smith, G. + 27 more2026-03-06📄 systems biology

Molecular Transducers of Physical Activity Consortium (MoTrPAC): Initial Insights into the Dynamic Human Responses to Exercise

Het Molecular Transducers of Physical Activity Consortium (MoTrPAC) heeft aangetoond dat zowel acut als chronisch toepassen van duur- en krachttraining bij gezonde, sedentaire volwassenen leidt tot onderscheidende fysiologische en moleculaire responsen die de basis vormen voor de gezondheidsvoordelen van deze bewegingsvormen.

MoTrPAC Study Group,, Brandt, A. R., Fleg, J. + 40 more2026-03-05📄 systems biology

Likelihood-Free Parameter Inference for Spatiotemporal Stochastic Biological Models using Neural Posterior Estimation

Deze studie introduceert een likelihood-vrije methode op basis van neurale posterior-schatting om parameters van spatiotemporale stochastische modellen voor celmigratie direct te infereren uit ruwe simulatiedata, waarmee de beperkingen van traditionele benaderingen zoals Approximate Bayesian Computation worden overwonnen.

Kimpson, T., Flegg, J., Simpson, M. J.2026-03-04📄 systems biology

Ageing impacts extracellular matrix turnover and remodelling in the kidney

Onderzoek met gebruikmaking van metabolische labeling bij muizen toont aan dat ouderdom gerelateerde nierfibrose voornamelijk wordt veroorzaakt door een verminderde afbraak van extracellulaire matrixcomponenten, wat leidt tot een sterk vertraagde vernieuwing van basale membranen en fibrillaire collagene, terwijl de structuur en interacties van deze eiwitten veranderen.

Preston, R., Hoyle, A., Stevenson Harris, A. + 6 more2026-03-04📄 systems biology

Comparison of different computational frameworks for metabolic modeling from single-cell transcriptomics data in glioblastoma

Deze studie vergelijkt drie computationele methoden voor metabolische modellering op basis van single-cell transcriptomics in glioblastoom en identificeert tumor-geassocieerde macrofagen als een metabolisch dominante populatie in het tumormicro-omgeving die een veelbelovend therapeutisch doelwit vormt.

De Temmerman, M., Vandemoortele, B., Vermeirssen, V.2026-03-03📄 systems biology

STRESS HISTORY ESTABLISHES A TRANSIENT TOLERANT STATE THAT SHAPES ANTIBIOTIC SURVIVAL UPON RESUSCITATION

Dit onderzoek toont aan dat bacteriën die uit een starre toestand worden gewekt, door hun eerdere stressgeschiedenis een tijdelijke tolerantie ontwikkelen die hen in staat stelt om β-lactam-antibiotica te overleven en de populatie snel te laten hergroeien, wat nieuwe inzichten biedt voor het optimaliseren van antibiotische doseringsstrategieën.

Abbott, K., Hardo, G., Li, R. + 3 more2026-03-03📄 systems biology

Single-Cell Spatial Proteomics Uncovers Molecular Interconnectivity among Hallmarks of Aging

Dit onderzoek gebruikt single-cell ruimtelijke proteomica in gist om te onthullen dat veroudering wordt gekenmerkt door een hiërarchische opeenvolging van celulaire storingen, waarbij nucleolaire disorganisatie, proteostase-verlies en mitochondriale disfunctie leiden tot ruimtelijke desorganisatie van eiwitten die ook bij menselijke veroudering voorkomen.

Yoo, S., Young, C., Li, L. + 6 more2026-02-28📄 systems biology

Aging under immunosuppression reshapes human immune compartments and lowers clinical alloreactivity after heart transplantation

Deze studie bij harttransplantatiepatiënten toont aan dat een hogere ontvangerleeftijd geassocieerd is met een verlaagde kans op afstoting, wat samenhangt met veranderingen in immuuncel-samenstelling en transcriptomische kenmerken van immunosenescentie die een gepersonaliseerde immunosuppressie ondersteunen.

Amancherla, K., Lin, P., Perera, B. L. A. + 9 more2026-02-26📄 systems biology